同じ元素からなる分子は必ずしも全部が同じではない。ある元素には同位体がある。同位体は同じ化学的性質を持っている。しかし違った原子量を持つ原子である。例えば、ふつうの酸素中には質量数１６、１７、および１８を持つ原子がある。同位体は同素体とは違う。同素体いうのは同一の元素の異なる単体である。例えば、オゾンは大気中の酸二原子分子が原子に分解して、その一原子が酸素二原子分子と結合して生ずる酸素の同素体である。またオゾンの化学的性質は酸素二原子のそれと大分違う。

Tidak semua molekul yang terdiri daripada unsur yang sama adalah serupa. Di anraranya terdapat isotop. Isotop memiliki sifat kimia yang sama. Namun begitu bagi suatu isotop, atomnya mempunyai berat atom yang berbeza.  Sebagai contoh ozon terdapat dengan nombor jisim 16, 17 dan juga 18. Isotop berbeza dengan allotrop. Unit tunggal dengan konfigurasi berbeza bagi unsur yang sama disebut sebagai allotrope. Sebagai contoh, ozon merupakan molekul dwiatom oksigen bergabung dengan satu atom oksigen yang terurai dari dwiatom molekul yang lain membentuk suatu allotrop. Tambahan pula, sifat kimia ozon sangat jauh berbeza dengan molekul dwiatom oksigen.

*isotop - unsur sama, nombor jisim berbeza
*allotrop - unsur sama, konfigurasi ikatan kimia berbeza